مطالعات qsar و 3d-qsar بر روی مشتقات 4?5?6?7- تتراهیدروتیئنو ]3?2-[c- پیریدین و آمینوپیرازولوپیریدین اوره

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده علوم پایه دامغان
  • نویسنده سودابه شریفی
  • استاد راهنما مرتضی عتباتی
  • سال انتشار 1391
چکیده

مطالعات qsar و 3d-qsar بر روی مشتقات 4?5?6?7- تتراهیدروتیئنو ]3?2-[c- پیریدین و آمینوپیرازولوپیریدین اوره به عنوان داروهای ضد انعقاد خون و ضد رگ زایی انجام گرفت. در مطالعه ی qsar از الگوریتم ژنتیک برای پیش گویی فعالیت ضد انعقاد خون درون سلولی 42 مولکول از مشتقات 4?5?6?7- تتراهیدروتیئنو ]3?2-[c- پیریدین استفاده شد. در بخش دوم، در مطالعه ی 3d-qsar، از مدل comsia برای پیش گویی بازداری فاکتور رشد اندوتلیال رگی بیرون سلولی 28 مولکول از مشتقات آمینوپیرازولوپیریدین اوره استفاده شد. در بخش سوم، در مطالعه ی 3d-qsar از روش های comfa و comfa تمرکز میدانی و comsia، برای پیش گویی بازداری فاکتور رشد اندوتلیال رگی درون سلولی همان سری از ترکیبات استفاده شد. همه ی مدل سازی های comfa و comfa تمرکز میدانی و comsia، با نرم-افزار مدل سازی مولکولی sybyl از شرکت tripos انجام گرفت. همه ی ترکیبات با استفاده از این نرم افزار رسم شدند و بارهای اتمی آنها با روش گاستیگر هوکل محاسبه و بهینه سازی انرژی بر روی آنها انجام شد. مولکول ها با روش distill موجود در این نرم افزار تراز شدند. برای ارزیابی مدل ها، مجموعه ی داده ها بر اساس تنوع ساختاری به دو دسته ی آموزش و آزمون تقسیم شدند. پارامترهای آماری بدست آمده مناسب بودن و قدرت پیش گویی بالای مدل ها را نشان می دهند. کانتورهای سه بعدی ایجاد شده راهنمایی های سودمندی را برای طراحی بازدارنده های قوی فراهم می کنند.

منابع مشابه

مطالعات 3d-qsar بر روی مشتقات کویینولین به عنوان بازدارنده فسفودی‏استراز4

مطالعات 3d-qsar بر روی تعدادی از مشتقات کوئینولین به عنوان دارو‏های بازدارنده‏ی فسفودی‏استراز ? انجام گرفت.. در این مطالعه‏ از روش‏های comfa، comfa تمرکز میدانی و comsia، برای پیش‏گویی میزان اثر بازدارندگی ?? مولکول از مشتقات کوئینولین روی فسفودی‏استراز ?، استفاده گردید. مدل‏سازی‏های comfa، comfa تمرکز میدانی وcomsia ، با نرم‏افزار مدل‏سازی sybyl از شرکت tripos انجام شد. ترکیبات با استفاده از ا...

15 صفحه اول

Rethinking 3D-QSAR

The average error of pIC50 prediction reported for 140 structures in make-and-test applications of topomer CoMFA by four discovery organizations is 0.5. This remarkable accuracy can be understood to result from a topomer pose's goal of generating field differences only at lattice intersections adjacent to intended structural change.

متن کامل

مطالعات داکینگ و QSAR بر روی گروهی از مشتقات تری‌آزول به‌منظور دست‌یابی به عوامل ضد قارچ قوی‌تر و مؤثرتر

اهداف: در این مطالعه، بر روی یک دسته از مشتقات تری‌آزول با اثر مهارکنندگی آنزیم CYP51 مطالعات داکینگ و به دنبال آن آنالیز رابطه فعالیت و ساختار کمی (QSAR) انجام گرفت. روش‌ها: با استفاده از برنامه‌ی Hyperchem ساختار مولکولی آزول‌های طراحی‌شده ساخته شد. برای انجام مطالعات داکینگ از برنامه AutoDock استفاده شد. در مطالعات QSAR، توصیف‌گرهای مختلفی محاسبه گردیدند. یافته‌ها: بر اساس نتایج به‌دست‌آمده ...

متن کامل

2D-QSAR and 3D-QSAR Analyses for EGFR Inhibitors

Epidermal growth factor receptor (EGFR) is an important target for cancer therapy. In this study, EGFR inhibitors were investigated to build a two-dimensional quantitative structure-activity relationship (2D-QSAR) model and a three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) model. In the 2D-QSAR model, the support vector machine (SVM) classifier combined with the feature...

متن کامل

3D QSAR Studies of 1,3,4-oxadiazole derivatives as antimycobacterial agents

Recently several 1,3,4-oxadiazole derivatives were identified as potentially active antimycobacterial agents. Various 5-aryl-2-thio-1,3,4-oxadiazoles have been reported having good antimycobacterial activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv (ATCC 27294). In this paper we report 3D QSAR studies for the 41 molecules of 1,3,4-oxadiazoles by using k-Nearest Neighbor Molecular Field Analysis...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده علوم پایه دامغان

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023